Brégnier-Cordon liegt im äußersten Süden des Départements Ain, wo sich die Rhône in einer markanten Schleife durch die Landschaft windet. Die Gemeinde grenzt im Nordwesten an Groslée-Saint-Benoît, das den Weiler Glandieu mit Brégnier-Cordon teilt, wo der Gland zu einem beeindruckenden Wasserfall, der Cascade de Glandieu, hinabstürzt. Im Osten und Süden reichen die Grenzen bis an Prémeyzel, Izieu, Champagneux und Saint-Genix-les-Villages, während im Westen die Rhône selbst die Grenze zum Département Isère bildet.
Erstmals erwähnt wird der Ort im Zusammenhang mit der Rhône und ihren natürlichen Gegebenheiten, doch seine heutige Gestalt prägte vor allem der Bau eines Laufwasserkraftwerks, das sich in der Gemeinde befindet. Der Fluss wird hier durch einen Stausee bei Murs-et-Gélignieux aufgestaut, von dem ein Kanal durch Brégnier-Cordon verläuft. Die wirtschaftliche Bedeutung des Kraftwerks ist bis heute spürbar.
Besondere Aufmerksamkeit verdienen die archäologischen Funde der Region, darunter ein bronze- oder eisenzeitlicher Einbaum, der im Musée Escale Haut-Rhône ausgestellt ist. Auch die Grotte von Lievrin und die prähistorische Höhle La Bonne Femme zeugen von der langen Besiedlungsgeschichte. Die malerische Flusslandschaft und die Nähe zum Wasserfall machen den Ort zu einem Anziehungspunkt für Naturliebhaber.
