Pegognaga liegt in der flachen Po-Ebene der Lombardei, etwa zwanzig Kilometer südöstlich von Mantua. Der Fluss Po verläuft nur wenige Kilometer nördlich der Gemeinde, die von fruchtbaren Feldern und sanften Hügeln umgeben ist. Mit seinen fast siebentausend Einwohnern zählt Pegognaga zu den kleineren Orten der Provinz.
Der Name geht vermutlich auf einen römischen Grundbesitzer namens Pecunius zurück, der hier vor fast zweitausend Jahren einen Hof betrieb. Später taucht der Ort als Flexum auf, bevor er sich zu seiner heutigen Bezeichnung entwickelte. Wirtschaftlich prägte lange die Landwirtschaft das Bild, doch die Nähe zu Mantua und die Anbindung an Verkehrswege brachten neue Impulse.
Heute ist Pegognaga vor allem durch seine historische Kirche San Giacomo Maggiore im Ortsteil Polesine bekannt, die ein bedeutendes Gemälde aus dem frühen 17. Jahrhundert beherbergt. Berühmte Söhne der Gemeinde sind der Bischof Augusto Bertazzoni und der Bahnradsportler Cesare Moretti sr. Die Autobahn A22 und die Bahnstrecke Suzzara–Ferrara verbinden den Ort mit der Region und darüber hinaus.
