Die Landgemeinde Sejny liegt im nordöstlichen Polen, mitten in der Seenlandschaft der Sudauen, die von zahlreichen Gewässern durchzogen ist. Der Fluss Marycha durchzieht das Gebiet, während an der Grenze zu Litauen der Gaładuś-See liegt, der zu den größten der Region zählt. Im Osten grenzt die Gemeinde direkt an Litauen, wo sich auch der Grenzübergang Ogrodniki befindet.
Historisch gehörte die Gemeinde bis 1998 zur Woiwodschaft Suwałki, bevor sie Teil der heutigen Woiwodschaft Podlachien wurde. Die heutige Struktur entstand nach Verwaltungsreformen, die auch die Zugehörigkeit zur Woiwodschaft Suwałki in den 1970er und 1980er Jahren prägten.
Die Gemeinde besteht aus 48 Ortsteilen, die sich über eine Fläche von 218 Quadratkilometern verteilen. Hier leben rund 3800 Menschen, verteilt auf Dörfer wie Babańce, Berżałowce oder Krasnogruda. Bekannt ist die Region auch durch den polnischen Freiheitskämpfer Szymon Konarski, der in Dobkiszki geboren wurde.