Pfullendorf liegt im hügeligen Linzgau, etwa zwanzig Kilometer nördlich des Bodensees, und erstreckt sich über die Europäische Hauptwasserscheide zwischen Rhein und Donau. Der Andelsbach fließt von den Höhen des Linzgaus in die Donau, während die Linzer Aach ihre Wasser dem Bodensee zuführt. Die Stadt ist umgeben von Nachbargemeinden wie Krauchenwies im Norden oder Herdwangen-Schönach im Südwesten und gliedert sich in mehrere Ortsteile, darunter Aach-Linz und Denkingen.
Die Wurzeln Pfullendorfs reichen bis in vor- und frühgeschichtliche Zeiten zurück, wie Grabhügel und Schanzenfunde belegen. Im 9. Jahrhundert entstand am heutigen Standort des Ortes eine Siedlung, die sich später unter dem Schutz einer Burg entwickelte. Im Jahr erhielt Pfullendorf das Stadtrecht und wurde zur Reichsstadt, was bis ins frühe 19. Jahrhundert Bestand hatte. Prägend waren zwei Frauenklöster – eines der Dominikanerinnen und eines der Franziskanerinnen – sowie das Heilig-Geist-Spital, das zu den ältesten seiner Art am Bodensee zählt.
Heute ist Pfullendorf eine Kleinstadt mit historischem Kern, der von ehemaligen Stadttoren und einer Stadtmauer geprägt ist. Die Klöster und das Spital hinterließen architektonische Spuren, ebenso wie die Überreste der mittelalterlichen Burg. Die umliegende Moränenlandschaft mit ihren Schutzgebieten und die Lage an der Wasserscheide machen die Stadt zu einem Ort zwischen zwei großen Flusssystemen.
